Barbora Hamidová (2024) Extensions of the y-mtPTM Database of Protein Modifications (školiteľka Bronislava Brejová)
Vanesa Šoošová (2024) Bioinformatics analysis of next-generation sequencing data in pancreatic cancer (školiteľka Mária Lucká)
Marek Kajan (2023) Analýza vínneho mikrobiómu (školiteľ Jaroslav Budiš)
Jana Černíková (2022) Live Monitoring of MinION Sequencing Runs (školiteľ Tomáš Vinař)
Klára Sládečková (2022) Tunnel planning of Burrows-Wheeler transform by employing integer linear programming (školiteľ Andrej Baláž)
Martina Babinská (2022) Identifikácia proteínových sektorov ako evolučných jednotiek bielkovín (školiteľ Ľubomír Tomáška)
Michaela Gažiová (2021) Predikčná metóda na určenie klinického dopadu štrukturálnej genomickej variability (školiteľ Jaroslav Budiš)
Veronika Tordová (2021) Databáza variantov v genóme viniča (školiteľ Bronislava Brejová)
Dária Čárska (2020) Detection of microsatellite instability from genomic data obtained by next generation sequencing (školiteľ Jaroslav Budiš)
Andrej Baláž (2018) Sequence based classification of bacteriophages (školiteľ Jaroslav Budiš)
Dominik Bujna (2018) Computational analysis of the genome of fungus Jaminaea angkorensis (školiteľka Bronislava Brejová)